目前认为遗传易感性是主要因素。AIH存在明显的家族成员集中发病现象，而病毒感染、药物和环境则可能是在遗传易感基础上的促发因素。体液免疫和细胞免疫反应均参与自身免疫性肝病(AIH)的自身免疫，AIH的免疫病理损伤机制主要涉及两个方面：

①T细胞(T淋巴细胞即T细胞【译】来源于骨髓的多能干细胞(胚胎期则来源于卵黄囊和肝)。在人体胚胎期和初生期，骨髓中的一部分多能干细胞或前T细胞迁移到胸腺内，在胸腺激素的诱导下分化成熟，成为具有免疫活性的T细胞。)介导的细胞毒性作用：CD4+T细胞(CD4+T细胞【译】其数量减少是艾滋病患病时的明显特征，也是HIV病毒主要攻击的目标)被激活后分化为细胞毒性T淋巴细胞，并通过释放毒性细胞因子直接破坏肝细胞。

②抗体依赖的细胞介导的细胞毒性作用(ADCC)：在T细胞的协同作用下，浆细胞分泌大量针对肝细胞抗原的自身抗体，它们与肝细胞膜上的蛋白成分反应形成免疫复合物，自然杀伤细胞通过Fc受体识别免疫复合物后引起肝细胞破坏。